Iontophorese ist ein der Elektrotherapie zugerechnetes biochemisches Verfahren.
Bei Gelenk- bzw. Haut-Erkrankungen werden Medikamente (meist Salben) mittels arzneitragender Ionen in das Blut oder in Gewebe eingeführt. Blutgefäße können auf diese Weise verengt oder erweitert werden.
Die Ziele bestehen beispielsweise in Schmerzstillen, insbesondere bei Entzündungen, sowie im Erweichen von Narben.
In Polen heißt das Verfahren Jontoforeza, in Tschechien iontoforéza.